制藥工程專業是一個化學、藥學（中藥學）和工程學交叉的工科類專業，培養能夠在醫藥、農藥、精細化工和生物化工等部門從事醫藥產品的生產、科技開發、應用研究和經營管理等方面的高級工程技術人才。
我校的制藥工程專業創建于2002年，是全國較早設立制藥工程專業的高等院校之一，具有本科、碩士和博士授予權。
培養目標：旨在培養具有創新思維、系統扎實地掌握管理等工作掌握化學藥物和天然藥物設計、制備和生產的基本理論與技術；具備化學藥物及中藥研究與開發、生產過程控制與管理的基本能力；富有創新精神和社會責任感，能夠在醫藥相關機構從事藥物研究與開發、生產過程控制、藥品質量檢驗、藥品經營與的高級制藥工程專門人才，具有國際視野和競爭力的創新性人才。
師資條件：現有制藥工程專任教授、副教授28名，中國工程院院士1名(兼職)，博士生導師 10 名，國家和省部級有突出貢獻專家 2 名，外聘國內外客座、兼職教授 5 名。
教學條件：擁有制藥工程教學實驗中心，陜西省天然藥物研究與工程重點實驗室，國家中醫藥局中醫藥科研實驗室。
培養特色：實施國際公認的工程教育CIDO卓越工程師人才培養模式，采取小班教學，理論教學與實踐緊密結合，結合創新人才培養計劃開展科研和教學互動，培養創新思維和創新藥物設計能力。
畢業去向：近50%保送或考取研究生，其余畢業生就業領域寬廣，供需比在1:8以上，就業層次高，既有國家藥物研究機構、政府機關，也有到輝瑞、羅氏、西安揚森、聯邦等大型制藥企業及藥物研究院所等單位工作。
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