大連醫科大學藥學院的前身是大連醫科大學臨床藥學系，建于1993年，2001年成立藥學院。建院以來，依靠堅實的醫學基礎發展藥學學科，無論在人才培養、社會服務、藥學基礎研究等方面都形成了學院自身發展的特色。
學院設有臨床藥學和藥學2個專業。臨床藥學專業1993年起開始招生，為國內第二家、遼寧省首家招生的專業，學制五年，畢業時授予醫學學士學位。2003年起設置藥學專業，學制四年，畢業時授予理學學士學位。
學院現有5個教研室和1個學生藥學綜合實驗室。承擔藥理學、臨床藥理學、藥物代謝動力學、藥物分析學、藥物化學、藥劑學、天然藥物化學、生物藥劑學、藥事管理學等多門專業課及專業基礎課的教學。學院有中西醫結合藥理學博士點1個，藥學一級學科碩士點1個，遼寧省教學團隊（藥理學，帶頭人：劉克辛）1個，藥理學重點學科（校級，帶頭人：劉克辛）1個。藥學院有博士生導師3名（劉克辛、林原、彭金詠），碩士生導師17名。擁有國家級教學質量工程之特色專業建設點項目1個（藥學，負責人：劉克辛），遼寧省普通高等學校本科示范專業1個（藥學專業，帶頭人：劉克辛），省級重點實驗室2個（遼寧省高校藥代動力學與藥物轉運重點實驗室、遼寧省科技廳藥代動力學與藥物轉運重點實驗室，主任：劉克辛）、省級工程技術研究中心1個（遼寧省抗肝炎創新藥物工程技術研究中心，主任：劉克辛）以及國家食品藥品監督管理局藥物臨床試驗機構I期臨床藥代動力學實驗室等學科建設平臺。
學院現有教職工41人，其中專業教師29人，教授9人，副教授7人，講師10人，助教3人；在編教師中博士22人（含在讀4人），占76％，碩士6人，占21％，本科1人，占3％。實驗技術人員8人。在編教師中一半以上有過在國外學習的經歷，師資隊伍學緣、學歷、職稱布局合理，教學和學術水平較高，具有良好的師德師風形象。
學院現有在校生573人，其中藥學139人，臨床藥學434人。我院畢業生就業心態較好，就業形勢樂觀，市場評價較高。畢業生分配去向主要有醫院、科研院所、高校、醫藥企業、繼續升學及出國深造等，多年來學院畢業生就業率達到100%。
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