本專業具有扎實的學科基礎、雄厚的師資力量和良好的實驗條件，擁有多個條件優越的學生科技創新與教學實踐基地，以及發酵工程及生物化工碩博士點，為學生學習與深造提供了極大的空間。本專業含生物工程和生物制藥兩個方向。
（1）生物工程方向
本方向主要培養具有以下知識和技能的專業人才：(1) 掌握微生物菌種選育、現代生化技術、生物工程工藝原理、生物工程與設備、生物反應優化控制等基本知識和技能；(2) 掌握基因工程、酶工程、細胞工程、發酵工程、生化工程、組織細胞培養、環境生物治理等現代生物高新技術的基本理論和技能。
（2）生物制藥方向
本方向主要培養具有以下知識和技能的人才：(1) 掌握基因工程、酶工程、細胞工程、發酵工程和生化工程等現代生物高新技術的基本理論和實驗技能；(2)掌握生物工程相關藥物的開發、生產原理、生產工藝、分離純化技術、質量監控和工程設計等；(3) 具有生物藥物新資源、新產品、新技術研究開發的初步能力。
畢業去向：生物工程公司、生物制藥公司、保健食品公司、環保公司、生物工程相關研究機構以及衛生防疫、商檢、外貿等部門。主要從事技術管理、工藝設計、工程設計、新產品開發、新技術研究、生物檢驗、技術監控等工作。畢業生也可在國內外繼續攻讀碩士、博士學位。
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