院 長：曾其毅教授
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第二臨床醫學院成立于2005年5月，設置在全國重點高等院校南方醫科大學的直屬附屬醫院——珠江醫院（首批三級甲等醫院）。珠江醫院是一所大型綜合性現代化醫院，是全國首批三甲醫院，2010年被評為全國百家改革創新醫院。醫院1947年建院，1978年成為第一軍醫大學第二附屬醫院，2004年8月隨第一軍醫大學整體移交廣東省，更名為南方醫科大學珠江醫院。
辦學資源豐富。擁有16.4萬平方米全國最大單體大樓的現代化醫療新區， 54個專業科室。醫療儀器設備先進，擁有最新型號的64排CT、3.0T核磁共振、大平板數字減影血管醫院造影系統等先進設備和完善的醫院信息系統（HIS）、遠程圖像會診系統、網絡課程視頻直播錄播系統等，設備總價值5.1億元。
師資力量雄厚。現有臨床醫學系、婦幼醫學系等二個學系及康復醫學院，醫務人員2231人，其中高級技術職稱人員363人，享受政府特殊津貼專家3人、國家杰出青年基金獲得者1人、珠江學者1人、廣東省教學名師1人，博士生導師55人、碩士生導師40人，臨床婦幼核心課程教學團隊被評為廣東省優秀教學團隊。
教學實力雄厚。學院是衛生部首批專科醫師培訓基地、衛生部全科醫師培訓基地、衛生部婦科腔鏡培訓基地、衛生部腦卒中篩查中心、全國康復醫師專科培訓基地、中國殘疾人聯合會康復技術培訓基地，擁有博士學位授權一級學科5個、博士點33個、碩士點38個；有國家重點學科2個（內科學<消化系病>、中西醫結合臨床醫學）、國家重點培育學科1個（骨外科學）、廣東省重點一級學科2個（臨床醫學、藥學）、國家臨床重點專科2個（兒科重癥、神經外科）、國家中醫藥管理局重點學科1個（中醫內科腎病學科）、廣東省臨床重點專科11個（神經外科、骨科、普通外科、泌尿外科、新生兒科、兒科重癥醫學、心血管內科、神經內科、呼吸內科、婦科、重癥醫學科）、廣東省重點實驗室2個（腦功能修復與再生重點實驗室、臨床醫學基礎研究所）。臨床醫學專業是國家特色專業、廣東省名牌專業、特色專業和廣東省高等院校專業綜合改革試點專業，臨床醫學(卓越創新班)是國家高等院校卓越醫生教育培養計劃項目試點專業，康復治療學和臨床婦幼專業是廣東省創新人才培養試驗區。有省級精品課程1門、校級精品課程5門、校級雙語課程6門。學院目前有在院本科生2000余名、研究生700余名、規范化培訓醫師110名、進修實習生600余名。
招生專業：臨床醫學（卓越創新班）、臨床醫學、臨床醫學（婦幼醫學方向）、康復治療學
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