第二臨床醫學院設在廣東醫學院東莞校區，學院開設臨床醫學和口腔醫學兩個專業，臨床醫學專業是“全國高等學校特色專業建設點”和“廣東省名牌專業”。臨床醫學專業是一級學科碩士點，面向全國招收碩士研究生。在校本科生3000多人，學生就業形勢良好,近三年就業率均在95%以上，大部分畢業生在珠三角地區就業。近兩年學生考研通過率達50%，部分學生被北京大學、復旦大學等著名大學錄取。
學院利用珠三角地區豐富的醫療資源，經過多年的建設和發展，已成為專業成熟，學科齊全，師資力量雄厚，教學管理規范的二級學院?，F有專任教師（含非直屬附屬醫院）350人，副高及以上職稱128人，具有博士、碩士學位的教師229人，占65.4%。擁有100多家臨床教學基地。
學院設有規模大、設備齊全、特色明顯的臨床技能培訓中心和模擬醫院，是廣東省教學示范中心，為學生臨床技能訓練提供了條件保證。我院學生獲得2012年第三屆全國高等醫學院校大學生臨床技能競賽華南賽區三等獎。
正在興建的附屬松山湖醫院占地357畝，建筑面積282800平方米，床位1000張，醫院門診已于2011年12月28日開業，將逐步發展成為一所功能完善、設備先進、技術精湛、管理規范、環境優美的三級綜合性教學醫院。醫院建成后將成為學院的主要臨床實踐基地。
學院秉承“立志立德、求真求精”的校訓，弘揚“醫德與醫術相長，人文與科學并重”的專業理念，實施“卓越醫生”培養計劃，堅持“臨床實踐能力培養5年不斷線，人文素質培養5年不斷線”的培養特色，努力培養基礎知識扎實、臨床實踐能力強、人文素養高、具有創新意識的應用型醫學人才。
臨床醫學
五年制 國家級特色專業建設點 廣東省高校重點專業 廣東省應用型人才示范專業 廣東省高校名牌專業 招收理科
授予本科畢業證書、醫學學士學位
培養目標：培養德、智、體全面發展的從事臨床醫療工作的通科醫學高級專業人才。要求學生掌握現代醫學基礎理論、基本知識和基本技能，能運用所學知識和技能診治人類常見病、多發病，能基本處理疑難危重疾病，有一定的預防醫學和中醫學基本知識及具有臨床醫學初步科研能力。
主要專業課程：以基礎醫學、臨床醫學等為主干學科。主要課程有系統解剖學、組織胚胎學、生理學、生物化學與分子生物學、醫學微生物學、醫學免疫學、病理學、藥理學、預防醫學、傳染病學、內科學、外科學、婦產科學、兒科學、神經病學、精神醫學等。
就業方向：畢業生畢業后在各級綜合性醫院、?？漆t院、醫學院校、疾病預防控制中心和衛生監督所、醫學科研部門和其他醫藥相關等部門從事臨床醫療、預防保健、醫學教育和醫學研究工作。
口腔醫學
五年制 招收理科生
授予本科畢業證書、醫學學士學位
培養目標：培養德、智、體全面發展的從事口腔醫療和保健工作的醫學高級專業人才。要求學生掌握基礎醫學、臨床醫學和口腔醫學的基本理論和基本技能，具有對口腔常見病、多發病的診治處理能力，具有口腔修復工作的基本知識和一般操作技能。具有臨床醫學初步科研能力，成為具有基礎寬厚扎實、實踐能力強，富有創新精神和良好職業素養的口腔醫學專門人才。
主要專業課程：以基礎醫學、臨床醫學和口腔醫學為主干學科。主要課程有系統解剖學、組織胚胎學、生物化學與分子生物學、病理學、藥理學、診斷學、內科學、外科學、兒科學、口腔解剖生理學、口腔組織病理學、口腔內科學、口腔頜面外科學、口腔修復學、口腔正畸學等。
就業方向：畢業生畢業后在醫學院校、醫院、科研部門和其他醫藥相關行業從事口腔臨床醫療、預防保健、醫學教育和醫學研究等工作。
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