公共衛生學院由我校與云南省地方病防治所“院所合作辦學”組建而成，有預防醫學和衛生檢驗兩個本科專業和流行病與衛生統計學碩士點。主持完成了廳級以上科研項目85項，獲得廳級以上科技成果獎67項，目前在研項目12項，其中國家自然科學基金資助項目3項，云南省科技計劃重點攻關項目1項。
預防醫學專業（本科五年）：培養從事衛生防疫、預防保健、衛生監督工作和預防醫學教學、科研工作的高級衛生人才。主要課程：基礎醫學、衛生統計學、流行病學、職業衛生和職業醫學、環境衛生學、營養與食品衛生學和少兒衛生學等課程。學位授予：醫學學士。就業方向：在疾病預防控制、衛生監督、環境保護、醫療衛生事業、醫學院校從事衛生防疫、保健、健康教育、衛生監督、教學和科研等工作。
衛生檢驗專業（本科五年）：培養具有衛生檢驗科學技術理論知識和實際工作能力的高級專門人才。主要課程：基礎醫學、預防醫學、衛生檢驗技術、微生物學檢驗、免疫學檢驗、生物材料檢驗、食品衛生檢驗、水質衛生檢驗、空氣衛生檢驗、食品衛生檢驗、衛生微生物學檢驗。學位授予：醫學學士。就業方向：在疾病預防控制、海關檢驗、檢疫、環境監測、食品衛生監測及勞動衛生監測等機構從事衛生檢驗工作。
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