動物藥學院是全國高職院校中最早獨立設置的動物藥學類院系，始創于1988年，現有在校生2000多人，專兼職教師100多人。師資力量雄厚，教學條件優越，開設有獸藥生產與營銷、動物醫藥、中藥制藥技術、生物制藥技術、藥品質量檢測技術等專業。擁有中央財政支持的職業教育實訓基地——江蘇倍康藥業有限公司、教育廳批準成立的“江蘇省動物藥品工程技術研究開發中心”、科技廳批準成立的“江蘇省獸藥代謝動力學研究服務中心”和“江蘇省獸用生物制藥高技術研究重點實驗室”。
獸藥生產與營銷（國家重點建設專業）
培養目標：培養面向獸藥生產、經營、監督管理等企事業單位，具有良好的職業道德、較強專業技能和可持續發展的學習與適應能力的技術技能人才。
主干課程：獸藥管理、市場營銷、獸藥生產技術、獸藥檢測技術、獸藥GMP及認證、獸藥GSP管理等。
就業方向：主要面向動物藥品生產、經營、監督管理等企事業單位的生產部門、銷售部門，可擔任生產工藝員、班（組）長、銷售員、業務經理，就業率99%以上，也可自主創業。
動物醫藥
培養目標：培養掌握獸藥制劑、獸藥營銷、動物保健的基本知識和綜合職業能力，從事動物醫藥行業獸藥營銷與技術服務、動物疾病診斷與防治等第一線工作的技術技能人才。
主干課程：獸藥藥理、動物藥品生產與檢測、動物傳染病、動物寄生蟲病、畜禽生產技術等。
就業方向：主要面向獸藥生產經營企業、獸藥銷售門店、畜禽養殖企業、畜牧獸醫站、動物醫院等企事業單位的銷售部、技術部、門診部，可擔任獸藥營銷與技術服務員、動物疫病防治員，就業率99%以上，也可自主創業。
中藥制藥技術
培養目標：培養具有必要的傳統中醫藥理論知識和較強的實踐能力，具有良好的職業道德和法制觀念，服務于基層醫院中藥房、中藥生產企業、中藥經營企業等部門技術技能人才。
主干課程：中藥鑒定技術、中藥制劑技術、中藥制劑分析技術、中藥飲片加工技術、中成藥學等。
就業方向：主要面向藥品生產經營企業、醫院等企事業單位的制劑車間、質檢部門、藥店等，就業率99%以上，也可自主創業。
生物制藥技術
培養目標：培養掌握生物藥物的生產與開發、生物藥物的分析與檢驗的基本知識和綜合能力，從事生物藥物生產經營相關環節藥品生產、藥品檢驗、藥品質量控制等第一線工作的技術技能人才。
主干課程：基因工程制藥、細胞生物學、細胞工程制藥、藥品制劑技術、藥品質量管理技術等。
就業方向：主要面向生物藥物生產企業、生物藥物研究所、藥品銷售公司、生物醫藥公司等企事業單位的生產部、質檢部、研發部，可擔任生產技術員、質檢員、新產品研發員，就業率99%以上，也可自主創業。
藥品質量檢測技術
培養目標：面向藥品生產、藥品檢驗、藥品經營管理等企事業單位，培養在藥品生產、檢驗、服務等一線能從事分析檢驗、質量管理等工作，德、智、體、美全面發展，具有職業生涯發展基礎的專科層次高級技術技能專門人才。
主干課程：藥物化學、藥品生物檢驗技術、藥品制劑技術、藥事管理、藥品質量管理技術等。
就業方向：主要面向人藥或獸藥生產企業、藥品檢驗所或獸藥監察所、醫院、經營管理等企事業單位的檢驗部門、生產部門、質管部門，可擔任分析檢驗員、質量管理員、生產工藝員以及產品研發員等，就業率99%以上，也可自主創業。
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