（1）屬于技術性的差款和一般責任事故的差款，經過及時查找確實無法核對時，可按規定的審批手續處理。即長款歸公，短款報損，不得以長款補短款。
（2）屬于當事者工作不負責任，玩忽職守，違章操作等原因造成的短款，應追究其經濟責任，視情節輕重和損失程度大小，賠償全部或部分損失，情節嚴重的要給予行政處分。
（3）屬于責任人監守自盜、侵吞公款，或挪用公款的，應以貪污論處，直至追究其刑事責任。根據財務制度規定，對于發生的長款或短款，必須查明原因，方可處理。在原因查明前，應由責任人出具“現金長短款審批表”，經主管會計簽署意見予以證明，主管財務的領導同意后，先記入“應收款”或“應付款”賬戶（或“內部往來”賬戶），待查明原因批準后再進行結轉，記入“其他收入”或“其他支出”賬戶。
出納員在崗位上要慎之又慎，認真細心。這就要求出納員除了在具體操作中增加復審復核外，還要及時進行現金賬目與庫存現金的核對清點，做到日清月結。即每項業務終了，應立即將現金賬目與結存情況進行核對，發現差錯立即查找；每日將現金日記賬的余額與庫存現金進行核對；定時將現金日記賬余額與“現金”總賬賬戶余額核對相符，并清查月末庫存現金金額，以達到賬存與實存相符。
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