水利工程系是廣東水利電力職業技術學院1973年恢復辦學以來一直設置的教學部門，至今已有36年的歷史。規模從最初的水工組、水工科，發展到目前的水利系，并于2004年進行了專業系部重組，由原來的水利系發展為水利工程系和土木工程系。多年來，水利工程系以其優良的辦學質量和人才培養，被社會譽為“廣東水利人才的搖籃”，在廣東水利行業有著較深廣的影響。
目前，水利工程系開設有水利水電建筑工程、水利工程、工程測量技術、水政水資源管理、港口航道與治河工程。其中水利水電建筑工程專業于2002年被評為國家級教學改革試點專業，2006年被評為省級示范性專業；工程測量技術專業于2008年被評為水利部示范專業。
近年來，水利工程系積極開展人才培養模式的研究和實踐，構建并實踐了以專業知識、職業能力和職業素質有機結合的教學體系。融合專業特點，制定并開始實施以工學結合為重點的新的人才培養方案。在保持專業特色的同時，我們緊貼水利行業發展的需要，不斷拓展專業方向，實現了“大專業、多方向”的專業辦學模式。積極倡導并實踐了討論式、案例式、以工作任務、工程項目為導向的教學方法，提高了教學質量，改革成果顯著。目前已建成國家級精品課程2門，省級精品課程3門，教指委精品課程2門，院級精品課程6門。
三十多年的辦學經歷，使水利工程系有一支較為成熟的職業教育教師隊伍，現有專任教師44人及教輔人員14人，專職政治輔導員6人。副高以上職稱27人，其中教授3人、副教授14人、高級工程師11人（其中2人為雙職稱）；中級職稱24人，其中講師17人，工程師7人（其中2人為雙職稱）。博士6人、在讀博士10人、碩士29人。專任教師中相當部分人員取得了注冊工程系列的資格或具有實際工程經驗，具備“雙師型”素質的教師有45人。同時在相關企業聘請了一批工程技術人員為兼職教師，極大地提高了專業教學的質量。
近年來，專業教師主持和參與省部級以上科研、教研課題37項，獲廣東省高等教育省級教學成果二等獎2次，獲廣東省教育軟件評審職教和高等教育組優秀獎1項；發表學術論文117篇，其中核心期刊31篇，被EI檢索5篇；共主編、副主編教材15本，參編教材10本。其中有“十五”國家級規劃教材1本，有“十一五”國家級規劃教材3本。
專業教師中，目前有1人擔任中國水利教育協會副會長，有2人擔任教育部高職高專水利水電工程專業教學指導委員會委員，1人擔任測繪專業教學指導委員會委員，有4人擔任中國水利教育協會高職高專水利水電工程專業教研會各專業組、課程組組長，有2人擔任廣東省水利學會副理事長和理事，1人擔任廣東省水利發電工程學會理事和廣東省巖土力學與工程學會理事。
水利工程系具有較為完善的校內系列實驗實訓場，包括水工設計實訓場、防汛搶險模擬實訓場、飛來峽教學實訓基地以及與廣州中冶正元測量工程公司、南方測繪儀器有限公司等企業共建的測繪數字化實訓中心等。實驗開出率達100％，初步形成了模擬仿真的職業情境，滿足了學生在校內開展實訓教學的需要。2008年，我系水利水電建筑工程專業實訓基地被評為廣東省高等職業教育實訓基地。
我院是廣東省唯一的水利類高職院校，長期以來，水利工程系與廣東省水利行業保持著緊密的聯系。依托廣東水利行業，校企共建校外實訓基地，其中包括國家一級大型水利水電施工企業廣東水電二局股份公司、廣東惠州水電建筑工程有限公司以及國家甲級水電建筑設計院——廣東省水利電力勘測設計研究院等，為學生開展實踐教學、頂崗實習提供了良好條件。
近年來，水利工程系充分利用人才和資源優勢，積極承接科研、工程項目設計，不斷擴大教育培訓規模。專業教師主持和參與了“西藏林芝地區水利‘十一五’規劃及其水利建設項目立項研究”等30多項科研課題，參與了“流溪河堤圍整治監理工程”等12項生產設計項目；承擔了面向廣東水利行業的非學歷短期職業技能培訓、崗位培訓、廣東省水利系統公務員和專業技術人員必修課培訓以及水利行業特殊工種技能競賽培訓40多期，培訓人員3192人次；開展了職業技能鑒定37期、鑒定7763人次。其中專業教師參與的“東江－深圳供水改造工程”項目獲“2003年度廣東省科學技術特等獎”和“2004年度中國建筑工程魯班獎”（國家優質工程）；由專業師生共同完成的“廣東省水庫移民后期扶持人口核定及扶持規劃外業調查”項目得到國家水利部的高度評價，參與項目的學生集體被共青團中央評為全國大中專學生志愿者暑期“三下鄉”社會實踐活動優秀團隊。
借助學院騰飛之際，水利工程系正計劃進行一系列的教學改革，走校企合作、工學結合之路，促進水利工程系的建設邁向新的臺階。
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